质押反担保的操作程序根据质押物不同，在具体操作上会有所差异。
(1)合同当事人以动产质押的，应当在合同约定的期限内将动产交付质权人。
(2)合同当事人以权利质押的，应当办理以下手续：
①以汇票、支票、本票、债券、存款单、仓单、提单出质的应当在合同约定的期限内将权利凭证交付质权人；
②以依法可以转让的股票出质的，应向证券登记机构办理出质手续；
③以有限责任公司的股份出质的，应适用法股份转让的有关规定；
④以依法可以转让的商标专用权、专利权、著作权中的财产权出质的，应向其他管理部门办理出质登记。
